Αποστρατεύτηκε το 1993 με βαθμό του Αντιστράτηγου ενώ από το 1985 ως το 1993 υπήρξε διοικητής της προσωπικής φρουρά του τότε προέδρου της ΝΔ Κωνσταντίνου Μητσοτάκη.
Κατά το πέρασμα του από την Κρήτη διετέλεσε διοικητής στο αστυνομικό τμήμα Περάματος στο Ρέθυμνο, στο αστυνομικό τμήμα της Ιεράπετρας ενώ είχε διατελέσει και στο αστυνομικό τμήμα των Χανίων.
Σήμερα στην εκκλησία του Άγιου Τίτου στο Ηράκλειο θα γίνει η κηδεία του τέως αρχηγού της Ελληνικής Αστυνομίας, Μιχάλη Νηστικάκη.
Ο Αντιστράτηγος Μιχάλης Νηστικάκης έφυγε από τη ζωή στο Βενιζέλειο Νοσοκομείο σε ηλικία 79 ετών όπου και νοσηλευόταν το τελευταίο διάστημα καθώς αντιμετώπιζε πρόβλημα υγείας.
Με καταγωγή από το Καστέλι Πεδιάδος αποστρατεύτηκε από την ΕΛ.ΑΣ. το 1993 με το βαθμό του Αντιστράτηγου
Από το 1985 ως το 1993 είχε διατελέσει διοικητής της προσωπικής φρουράς του τότε προέδρου της ΝΔ Κωνσταντίνου Μητσοτάκη.
Το ίδιο διάστημα υπηρέτησε με απόσπαση ως φρούραρχος στη Βουλή, Αστυνομικός διοικητής Βορείου Ελλάδος με έδρα τη Θεσσαλονίκη ως υποστράτηγος και υπαρχηγός στην Ασφάλεια Αθηνών.
Είχε πτυχίο της Νομικής σχολής του Πανεπιστημίου Αθηνών ενώ είχε υπηρετήσει με την αποφοίτηση από τη σχολή αξιωματικών της Ελληνικής Χωροφυλακής στην Αθήνα, στη Χίο, στη Ζίτσα Ιωαννίνων, ενώ το 1975 υπηρέτησε ως διοικητής στο αστυνομικό τμήμα Περάματος Ρεθύμνου.
Ήταν νυμφευμένος με την Αικατερίνη Νηστικάκη από το 1974 και μαζί απέκτησαν δύο δίδυμες κόρες.