Η Β’ ΜΚ συγκροτήθηκε στη Βουλιαγμένη Αττικής τον Ιούνιο 1947 ως Β’ Διοίκηση Καταδρομών και περιέλαβε δέκα από τους είκοσι πρώτους Λόχους Ορεινών Καταδρομών (ΛΟΚ), που εκπαιδεύτηκαν στο ΚΕΜΚ (Κέντρο Εκπαιδεύσεως Μονάδων Καταδρομών).
Η Β’ ΜΚ και η Ε’ ΜΚ (που εδρεύει στη Δράμα) είναι οι δύο βασικές μονάδες των Ειδικών Δυνάμεων στα βόρεια σύνορα της χώρας. Οι αποκαλούμενες και “Βόρειες Μοίρες” έχουν ως κύρια αποστολή τη σχεδίαση και την εκτέλεση επιχειρήσεων ανορθόδοξου πολέμου στην Ήπειρο, τη Μακεδονία, τον Έβρο καθώς και σε συγκεκριμένους τομείς του Αιγαίου.