O νέος υπεύθυνος για τη φύλαξη των πυρομαχικών προέβαινε στην τυπική καταμέτρηση, παρουσία του παραδίδοντος οπλονόμου, όταν διαπίστωσε ότι τα πυρομαχικά και το πολεμικό υλικό που έπρεπε να είναι έτοιμα μέσα σε σάκους προορισμένους για χρήση από κομάντος των ειδικών δυνάμεων του Πολεμικού Ναυτικού -τα μέλη των ομάδων υποβρυχίων καταστροφών- υπολείπονταν αυτών που ήταν καταγεγραμμένα.
Έπειτα και από δεύτερο, επαναληπτικό έλεγχο, έγινε σαφές ότι από τον φόρτο μάχης έλειπαν δύο αντιαρματικά, οπλοβομβίδες, χειροβομβίδες, βραδύκαυστο φυτίλι και μερικές δεκάδες σφαίρες.
Στην ίδια αποθήκη φυλάσσονταν και πολεμικά τυφέκια τύπου G3 και FN τα οποία βρίσκονταν στη θέση τους.
Το ερώτημα αυτό προσπαθούν να απαντήσουν οι υπεύθυνοι της Υπηρεσίας Ναυτικών Τεχνικών Εγκαταστάσεων Λέρου και η ηγεσία του Γενικού Επιτελείου Ναυτικού.
Το υπουργείο Εθνικής Άμυνας ζήτησε τη συνδρομή του υπουργείου Δημοσίας Τάξης και της ελληνικής Δικαιοσύνης.
Κλιμάκιο της Αντιτρομοκρατικής μετέβη στη Λέρο για να προσφέρει την βοήθειά του στις έρευνες, αποκαλύπτοντας ότι ο βαθύτερος φόβος των αξιωματικών του Πολεμικού Ναυτικού είναι μήπως πρόκειται για κλοπή στρατιωτικού υλικού από επίδοξους τρομοκράτες.
Η βάση του Πολεμικού Ναυτικού στη Λέρο, η αποκαλούμενη ΥΝΤΕΛ, σφραγίστηκε από το πρωί. Το στρατιωτικό προσωπικό έχει διαταχθεί να επιστρέψει στις εγκαταστάσεις που βρίσκονται στο Λακκί της Λέρου.
Οι εμπλεκόμενοι με τις υπηρεσίες φύλαξης των αποθηκών πυρομαχικών, ειδικότερα οι υπεύθυνοι φύλαξης του φόρτου μάχης δίνουν καταθέσεις στους υψηλόβαθμους αξιωματικούς του Πολεμικού Ναυτικού και της Ελληνικής Αστυνομίας που έχουν αναλάβει τη διαλεύκανση της υπόθεσης.
Η «ασυμφωνία προβλεπόμενου και κατεχόμενου στρατιωτικού υλικού» -όπως χαρακτηρίζεται επισήμως η υπόθεση από το Πολεμικό Ναυτικό- προσλαμβάνει χαρακτηριστικά μυστηρίου.
Η αποθήκη όπου φυλασσόταν το πολεμικό υλικό για τις ειδικές δυνάμεις δεν είχε ίχνη παραβίασης. Οι διπλές κλειδαριές δεν είχαν ίχνη ανθρώπινης παρέμβασης, συναγερμός δεν είχε ηχήσει. Στην προσπάθεια εξιχνίασης του πρωτοφανούς περιστατικού θα αξιοποιηθεί οπτικό υλικό αφού η αποθήκη παρακολουθείται από κλειστό κύκλωμα παρακολούθησης.
Το ερώτημα είναι πότε έγινε η κλοπή ή πότε μεταφέρθηκαν τα αντιαρματικά, οι οπλοβομβίδες και οι χειροβομβίδες χωρίς να καταγραφεί.
Οι κάμερες έχουν υλικό τριών μηνών, όμως η απώλεια του υλικού μπορεί να έχει συμβεί οποιαδήποτε στιγμή από τις 31 Δεκεμβρίου 2018 -όταν είχε γίνει ο τελευταίος έλεγχος- μέχρι τη χθεσινή ημέρα 9 Σεπτεμβρίου 2019, οπότε διαπιστώθηκε η απουσία του φόρτου μάχης.